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takeshiさん、こんにちは。

手順としてはreadmeのとおりのようなので、間違っていないと思います。
確認したい点として二点あります。
一つ目が、
# tar -xvPf gng_console_pkg
のところで応答メッセージにエラーがないかどうか、エラーがあれば書き込み権限などの問題がある可能性が在ります（ユーザがroot権限ないとか...）。

二つ目がtarで展開したgng_console_pkgのオーナー/グループです。

# ls -l /usr/local/groundwork/foundation/feeder/nagios2collage_socket.pl
# ls -l /usr/local/groundwork/foundation/feeder/PR_NagiosFeeder.pl
# ls -l /usr/local/groundwork/apache2/htdocs/prevc/framemain.php
# ls -l /usr/local/groundwork/apache2/htdocs/prevc/ConsoleFrame1.php
# ls -l /usr/local/groundwork/foundation/container/webapps/jboss/jboss-portal.sar/portal-core.war/shell/groundwork/ce-event-console-portlet.html
を実行して、owner/group が nagios/nagios かを確認してみてください。
（ちなみに、ls-lでは、下記のようになる筈です）

nagios2collage_socket.pl　：　-rwxr-xr-x nagios/nagios 93185 2011-08-16 12:15:51
PR_NagiosFeeder.pl　：　-rwxr-xr-x nagios/nagios 13538 2011-08-16 10:46:24
framemain.php　：　-rw-r--r-- nagios/nagios 5685 2011-06-16 17:55:03
ConsoleFrame1.php　：　-rw-r--r-- nagios/nagios 11979 2011-06-17 16:24:41
ce-event-console-portlet.html：-rw-r--r-- nagios/nagios 10652 2011-06-16 16:59:02

ownerや権限が異なっている場合、上記に合わせてみてください。