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karitaさん、こんにちは。

karitaさんはすでにご存知だと思いますが...
GroundWork/Nagios で check_ssh_* プラグインが正しく動作するためには、

１）　GroundWokr/Nagios サーバ側で nogios ユーザになり、　監視対象サーバに対して
　　ログイン＆パスワードなしで check_ssh_* プラグインが実行できる

２） check_ssh_* プラグインを実行すると、その「実行結果行のみ」が表示される

という環境が必要です。

その確認ですが、GroundWokr/Nagios サーバ側　su - nagios で nagios ユーザになって、
GroundWork/Nagios で設定しているコマンドラインを実行してみてください。

コマンド行の直ぐ下に一行のみ、結果行が表示されるでしょうか？

何か余計な表示やログイン＆パスワード要求があるなら、SSHと関連設定に問題があります。

直し方は現象によってさまざまですが...本家のフォーラムでは、「motd を停止する」とか
「sshd_configでバナーをnoneにする」という話も出ていました。
（いまどき、こんな設定をしているサーバなんて少ないと思いますが...どうでしょ？）

上記の確認でOKであれば、確認として　GroundWorkのコンフィギュレーション --> サービス
で対象のサービスを選ぶと表示される設定画面で、サービスチェックのタブをクリックしますと、
サービスの実行確認テストが行える部分があります。

そこでホストを指定して、テストボタンを押してみてください。

そこで、どう表示されますか？　OKがであれば、多分指定したホスト名（FQDNでしたか？)
とSSHの設定で使ったホスト名とが食い違っている可能性があります。

NGの場合、同様に、ホスト指定の仕方（IPアドレスとか、short名とか...）がおかしいかも
知れません。

karitaさんとはちょうど逆の場合ですが、本家のサイトで"Host key verification failed."
で問題になっているQ&Aがありました。
http://www.groundworkopensource.com/community/forums/viewtopic.php?f=23&t=2443&hilit=Remote+command+execution+failed%3A

参考まで。