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FUJI_KATSUさん
5.2.1にされた理由は分かりました。でも、メモリ搭載が1GBに満たないって、ひょっとして、512MBですか？
GWMを稼動させるにはかなり非力ですね。（ちょっとその点が不安です。）　

送っていただいた情報についてですが、

１）コミット
　　プリフライトの結果は問題ないようです。
　　コミットに結果は、どうでしょうか？
２）確認
　　30分もしてだめなら、おかしいですね。
３）Nagiosの不具合
　　問題なさそうですね。ps aux | grep httpdの結果やps aux | grep mysqlの結果を見ても、別におかしそうなところはありません。
４）ハード条件として、仮想OS上は多分問題はないと思いますが、ハード条件でメモリ搭載が仮想OS環境ということも手伝って、原因になっている可能性は否定できません。

このような条件で、Nagiosに構成設定情報が反映されない場合の状況としては、コミット時にメモリ不足で処理プロセスがうまく動かなかった...などの可能性が考えられないことはありません。
その場合、
a)GroundWorkデータベースから、Nagiosのcfgファイルが作成されていない。
b)Nagiosのリスタートがうまくいっていない。（つまり、前のままで稼動継続）　
の事象が考えられます。

Nagiosのcfgファイルが作成されているかどうかを確認するために、
/usr/local/groundwork/nagios/etc
の下の.cfgファイルの作成（変更）日時を確認してください。コミットした時間であれば、作成まではうまく言っていると思います。（注意。コミット実行時のメッセージを確認する必要はあります。）
とりあえずホストの追加を確認するため、hosts.cfg　をエディタで開いてみて、追加したはずのホスト名が入っているかを確認してください。　define host の構造で個々のホストが定義されており、その中（メンバー）の host_name　の行です。

この確認でデータが入っている場合、Nagiosの一度、Nagiosのリスタート
　# /etc/init.d/nagios restart

あるいは、GWMの再起動
　# /etc/init.d/gwservices restart

をしてみたらどうでしょうか？