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こんにちは
お尋ねの件ですが、以下の方法で設定してみてください。

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1．アプリケーションランチャーからコンフィグレーションへ移動。
2．左のツリーから通知先を割り振りたいホストの詳細画面へ移動。
3．コンタクトグループの項目で左にあるチェックボックスのチェックを外してください。
4．追加したいコンタクトグループを右から選択して<<追加ボタンを押下してください。
5．最下部の保存ボタンを押下してください。
6．プリフライト→コミットを行ってください。
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チェックボックスにチェックが入っていると、今現在の設定を継承します。
つまり、何かを変更したい場合はその項目の隣にあるチェックを外してから行うと反映されます。

お試しください。

追記：
cfgファイルに(GW上で)設定したはずのものが反映されていないのは仕様だと思います。
コンフィグレーションの機能を使用して登録した項目はDB内に保存されています。コミットを使用してcfgに反映させる場合に
GWは実際の監視に使用するもののみを書き出す仕様になっているので、上記のようにチェックが入っていた場合は変更が行われなかったとみなして
ファイルに新たに書き出さないようになっていると思われます。

ホストグループに対するコンタクトグループの設定は、グループの上でクリックしてください。
選択すると青く表示され、ctrlやshiftキーで増減が可能です。